牟氏水龟会冬眠，当气温低于摄氏15度时，牟氏水龟就会钻入土中冬眠。幼牟氏水龟不会冬眠，只会到2~3岁才冬眠。夏天如果气温超过30度，牟氏水龟也会进入夏眠状态，需要注意夏天的降温措施。
牟氏水龟的栖息地通常是沼泽浅滩和湿润泥泞的草地，在春夏秋三个季节活动频繁，冬季会在野外淤泥中冬眠，为了冬眠或者避免夏天的高温、敌害，牟氏水龟通常会把自己深深的埋在泥塘的底部。基本饲养环境以箱龟的方式比较合适，牟氏水龟在水中活动的时间并不长，水泽区可以占饲养缸的2/5，陆地区占3/5。不过幼牟氏水龟比较倾向水栖，所以水泽区可以占到饲养缸的1/2。
