辐射陆龟分公母从尾巴分辨，但是并不容易判断。腹甲靠尾端的开口角度较小的通常是母龟，因为母龟尾巴较细小。
公龟尾巴较长也较大，将它平平抓起时，公龟有时会将尾巴由下朝前方卷起。从腹甲分辨，需要到一定程度大小才能看得出来。公龟的腹甲明显凹陷这点幼龟较难判断，母龟则是平的，个别也会凹陷。成年公龟会主动闻对方泄殖孔确认对方性别，母龟则不会。
辐射陆龟分公母可藉由咽盾(gular scute)和肛弯入(analnotch)来做区分。雄龟的咽盾会开叉且发达，而且肛弯入的开口角度较大，而雌龟的肛弯入开口角度较小。
